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[科普中國]-miRNA檢測

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miRNA檢測是一種檢測生物體內(nèi)miRNA表達(dá)情況的技術(shù),包括Northern雜交、微陣點分析、實時定量PCR等。檢測miRNA的表達(dá)豐度,對疾病的診斷和治療具有一定的意義。

常見檢測方法1.Northern雜交
該方法通過將RNA變性及電泳分離后,將其轉(zhuǎn)移到固相支持物上,從而用于雜交反應(yīng),Northern雜交不僅能夠靈敏檢測出RNA的豐度,還能結(jié)合RNA marker來檢測RNA的分子大小,這對于排除其他小分子RNA的污染有重要意義。Northern雜交也可用作miRNA的定量分析,只需將已知濃度梯度的寡核苷酸對照物與待測樣品進(jìn)行平行雜交即可。該方法的缺點是耗時、耗量,一次檢測需要3個工作日,需要5到10微克的總RNA量才能成功檢測出miRNA。
2.微陣點分析
采用高密度的熒光標(biāo)記探針與RNA樣本雜交,通過熒光掃描獲得表達(dá)圖譜,借助相應(yīng)軟件進(jìn)行miRNA的表達(dá)分析。由于在設(shè)計探針時可以包含所有可用miRNA序列,因此微點陣可以作高通量的miRNA分析。不足之處在于需要足夠的RNA初始樣本,大約為每個微點陣5微克。
3.實時定量PCR
該方法主要是在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基因,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析。既可檢測miRNA前體,又可檢測成熟miRNA的表達(dá)。與雜交方法相比,實時定量PCR可以高度靈敏地檢測出低豐度表達(dá)的靶分子,也常用于miRNA表達(dá)譜結(jié)果的鑒定。目前已有新的實時定量PCR的方法,利用莖環(huán)狀引物進(jìn)行miRNA的反轉(zhuǎn)錄,然后再進(jìn)行實時定量PCR。
以上三種檢測方法中,Northern雜交法是驗證和確認(rèn)miRNA的重要方法,但比較繁瑣且靈敏度低,不適于臨床樣本的高通量檢測;實時定量PCR法是最方便使用且有效的檢測方法。

臨床應(yīng)用由于miRNA具有高度特異性、高度保守性,可以提高疾病診斷的準(zhǔn)確性和精確度。另外,根據(jù)miRNA時序性的變化特點,可以針對患者血漿、血清、尿、唾液中的miRNA表達(dá)的變化確定患者疾病的進(jìn)展情況,并制定相應(yīng)的個體化治療方案。此外,miRNA檢測對新型生物醫(yī)藥制劑的研發(fā)也具有重要意義。