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圖 | 細(xì)胞中復(fù)雜的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)

在此次工作中，研究團(tuán)隊利用 AlphaFold 生成的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，探索了現(xiàn)有模型是否能夠準(zhǔn)確預(yù)測細(xì)菌蛋白與抗菌化合物的相互作用。

這種模擬已經(jīng)成功地應(yīng)用于針對單個蛋白質(zhì)靶標(biāo)篩選大量化合物的研究中，來確定可以實現(xiàn)最佳結(jié)合的化合物。但是，當(dāng)他們試圖針對許多潛在目標(biāo)篩選多種化合物時，AlphaFold 預(yù)測的準(zhǔn)確性要低得多。

此外，研究團(tuán)隊還發(fā)現(xiàn)，通過將模型產(chǎn)生的預(yù)測與實驗室實驗中獲得的 12 種必需蛋白質(zhì)的實際相互作用進(jìn)行比較，模型的假陽性率與真陽性率相似。這就表明，該模型無法一致地識別現(xiàn)有藥物與其靶標(biāo)之間的真正相互作用。

研究團(tuán)隊認(rèn)為，“AlphaFold 預(yù)測的結(jié)構(gòu)似乎與實驗確定的結(jié)構(gòu)大致相同，但如果我們要在藥物發(fā)現(xiàn)中有效和廣泛地使用 AlphaFold，我們需要在分子對接模型方面做得更好。”

論文鏈接：

https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/msb.202211081

8.大質(zhì)量恒星形成研究取得進(jìn)展

在恒星形成過程中，原子氣體與分子氣體的轉(zhuǎn)換以及分子外向流的驅(qū)動源是研究難點。

近日，中國科學(xué)院紫金山天文臺、國家天文臺，以及三峽大學(xué)、湖南文理學(xué)院等合作，結(jié)合 FAST HI 譜線數(shù)據(jù)與紫金山天文臺青海觀測站 13.7 m 毫米波望遠(yuǎn)鏡分子譜線數(shù)據(jù)，利用團(tuán)隊自主開發(fā)的新基線校準(zhǔn)算法，在大質(zhì)量恒星形成研究中取得系列進(jìn)展，展現(xiàn)了 FAST 與 13.7 m 毫米波望遠(yuǎn)鏡的協(xié)同觀測研究的潛力。

磁離心噴流理論預(yù)言分子外向流是由高速 HI 星風(fēng)驅(qū)動，但該理論沒有得到確鑿觀測證明，這是由于探測 HI 星風(fēng)頗具挑戰(zhàn)性。在小質(zhì)量恒星形成區(qū)中 HI 星風(fēng)能夠驅(qū)動分子外向流。但是，在大質(zhì)量恒星形成區(qū)中，HI 星風(fēng)能否驅(qū)動分子外向流，原子氫從何而來，與分子氫關(guān)系如何，這一系列問題尚不清楚。

為了探測 HI 星風(fēng)，研究開發(fā)了新的基線校準(zhǔn)算法——FFTEEC。該算法能夠最大限度地降低基線噪聲，使最終得到的譜線靈敏度接近理論水平。該算法使得 FAST 的高靈敏度優(yōu)勢得以充分發(fā)揮，使 FAST 成為探測 HI 星風(fēng)的利器。

此外，科研人員首次在該區(qū)域中探測到 HI 星風(fēng)，并發(fā)現(xiàn)大質(zhì)量恒星形成區(qū)中的 HI 星風(fēng)有可能驅(qū)動分子外向流，這與小質(zhì)量恒星形成區(qū)情況相似。進(jìn)一步研究表明，星風(fēng)中的 HI 豐度與 HINSA 豐度一致，這預(yù)示 HINSA 將成為探究 HI 星風(fēng)與分子外向流的物理橋梁，同時 HI 星風(fēng)中原子氫更有可能繼承母分子云。

內(nèi)容來源：中科院紫金山天文臺

9.當(dāng)打不死的小強(qiáng)變身“半機(jī)械蟑螂”......

蟑螂，也就是人們常說的“小強(qiáng)”，是一種人人恨得咬牙、欲除之而后快的奇特生物。

但是，小小的蟑螂，也有大用，比如被部署在搜索和救援任務(wù)中，或者調(diào)查比較危險的地方。然而，遠(yuǎn)程控制與長時間續(xù)航的需求一直是尚未解決的問題。如今，這一想法或許即將成為現(xiàn)實。

近日，日本理化學(xué)研究所（RIKEN）開創(chuàng)性研究集群（Cluster for pioneer Research，CPR）的研究團(tuán)隊及其合作者，設(shè)計了一種可以制造遙控半機(jī)械蟑螂的系統(tǒng)。

圖｜半機(jī)械蟑螂示意圖。

據(jù)介紹，該系統(tǒng)配備了一個可由太陽能充電的微型無線控制模塊，可實現(xiàn)自供電，而且超薄的電子設(shè)備和柔性材料可以使半機(jī)械蟑螂自由移動。

研究團(tuán)隊認(rèn)為，半機(jī)械蟑螂的問世，或?qū)⑹拱霗C(jī)械昆蟲應(yīng)用在現(xiàn)實生活中成為可能。

論文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s41528-022-00207-2

10.我們正處于新的地質(zhì)時代——“人類世”

近數(shù)十年，人類活動干擾了自然環(huán)境，對人類自身也造成了不小的負(fù)面影響。有學(xué)者提出當(dāng)今的地球系統(tǒng)狀態(tài)已不同于全新世，應(yīng)該處于一個新的地質(zhì)時代——“人類世”，強(qiáng)調(diào)人類活動對地球系統(tǒng)的影響程度已和自然過程相當(dāng)，甚至超過了自然過程。

隨著人類活動的逐漸增強(qiáng)，地球系統(tǒng)從 20 世紀(jì)中期（約 1950 CE）開始發(fā)生全球尺度的加速變化，這個時間被稱為“大加速”，國際人類世工作組建議該時間為“人類世”的起始時間。但學(xué)術(shù)界對“人類世”起始時間仍有爭議，主要是因為在此之前人類已通過農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、礦產(chǎn)開發(fā)、聚落建設(shè)等對地球環(huán)境造成了較大程度的干擾，中國的季風(fēng)區(qū)尤其顯著。

研究人員總結(jié)發(fā)現(xiàn)，近 2000 年中國發(fā)展歷史可分成四個歷史階段：

（1）2.0~1.0 ka，核心區(qū)樣點的幾種代用指標(biāo)（包括木本孢粉比率、磁化率、有機(jī)碳同位素、鉛含量）因人類活動的影響開始明顯偏離自然背景，不同樣點開始偏離的時間不同，指示人類活動有局地性增強(qiáng)的特征；

（2）1.0 ka~1950 CE，核心區(qū)樣點的以上指標(biāo)整體顯著偏離自然背景，指示人類活動在核心區(qū)有區(qū)域性的增強(qiáng)，而同時期邊緣區(qū)的代用指標(biāo)的大致保留在自然狀態(tài)；

（3）1950~1980 CE，有機(jī)碳、總氮及其同位素發(fā)生顯著變化，核心區(qū)和邊緣區(qū)樣點無明顯差異，指示了中國全區(qū)域人類活動明顯增強(qiáng)，這些指標(biāo)的變化主要是受農(nóng)業(yè)、工業(yè)活動以及人口增長的影響；

（4）1980 CE 以后，以上指標(biāo)的變化進(jìn)一步增強(qiáng)，同時鉛、黑炭、多環(huán)芳烴含量急劇增長，反映出中國工業(yè)的快速發(fā)展以及農(nóng)業(yè)的現(xiàn)代化。

圖｜中國人類活動發(fā)展的四個歷史階段

其中，1950 CE 中國核心區(qū)和邊緣區(qū)的同步變化與全球“大加速”時間一致。以上四個時期的界線均可對應(yīng)重大歷史事件，同時也對應(yīng)了生產(chǎn)力或生產(chǎn)關(guān)系的重大變革。該研究提出，交通網(wǎng)絡(luò)和工業(yè)化在人類活動的區(qū)域影響方面有重要作用。

內(nèi)容來源：中科院地球環(huán)境研究所

論文鏈接：

https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0048969722052482

11.長江鱘沒有滅絕？野外滅絕不等于野外沒有

2022 年 7 月 21 日，世界自然保護(hù)聯(lián)盟（IUCN）更新瀕危物種紅色名錄。名錄顯示，長江特有物種白鱘（Psephurus gladius）已經(jīng)滅絕，長江鱘（Acipenser dabryanus）野外滅絕。

然而，近日一尾長江鱘在湖北省團(tuán)風(fēng)縣羅霍洲灘被困沙灘水坑，經(jīng)熱心市民和漁政工作人員救助后已被成功放生長江。有網(wǎng)友比較疑惑，野外滅絕不等于滅絕嗎？

針對此事，專家表示，近日發(fā)現(xiàn)的長江鱘是人工放流個體，這種情況較為常見，與此前公布的長江鱘野外滅絕沒有關(guān)系。

“長江鱘沒有滅絕，而是叫野外絕跡。就是說長江鱘在自然界沒有自然繁殖了，并不是說野外沒有長江鱘，這是個誤解?，F(xiàn)在每年都有增殖放流，所以野外還是有個體的。如果長江鱘能夠自然繁殖，野外滅絕這個帽子就可以摘掉了。”

危起偉還介紹，從 2007 年人工放流開始，長江鱘遭到誤捕的情況每年都有很多。原來長江一直沒有休漁，上游下來的很多魚類沒有等它長大就被捕獵了。長江鱘魚一直沒有自然繁殖，科研人員希望通過人工放流，經(jīng)過幾年時間的野外生長，最終實現(xiàn)長江鱘的自然繁殖。

內(nèi)容來源：紅星新聞

12.清華團(tuán)隊揭示中國清潔空氣行動的碳減排協(xié)同效益

近年來，中國實施的清潔空氣行動推動了大氣污染物大幅減排，其對氣候變化的影響受到廣泛關(guān)注。清潔空氣行動影響氣候變化的相關(guān)研究主要關(guān)注空氣污染引起的輻射反饋變化等氣候因素，目前僅有個別研究測算了重點區(qū)域?qū)嵤┣鍧嵖諝庑袆訋淼奶紖f(xié)同減排效益，尚未有研究量化 2013 年《大氣污染防治行動計劃》實施以來中國清潔空氣行動對全國碳排放的協(xié)同減排貢獻(xiàn)，并從措施角度進(jìn)行深入分析。

針對這一問題，清華大學(xué)地球系統(tǒng)科學(xué)系張強(qiáng)課題組回顧和梳理了中國清潔空氣行動中落后產(chǎn)能淘汰、工業(yè)燃煤鍋爐整治、民用散煤清潔化替代、“散亂污”整治以及淘汰黃標(biāo)車及老舊車輛等 5 項協(xié)同減排措施，在自主研發(fā)的中國多尺度排放清單模型的基礎(chǔ)上進(jìn)一步構(gòu)建措施級別協(xié)同減排效應(yīng)評估技術(shù)，并根據(jù)各省實際落實情況量化了各項協(xié)同減排措施帶來的能源供應(yīng)和消費結(jié)構(gòu)變化，最終核算出清潔空氣行動產(chǎn)生的碳減排協(xié)同效益。

圖｜中國清潔空氣行動中五項協(xié)同措施在2013-2020年間產(chǎn)生的二氧化碳協(xié)同減排量

研究顯示，中國清潔空氣行動中涉及控制能源消費總量、調(diào)整能源結(jié)構(gòu)和提升能源效率的相關(guān)措施，通過淘汰或升級低能效、高污染的落后燃燒設(shè)施促進(jìn)了中國能源系統(tǒng)的轉(zhuǎn)型，減少了化石燃料消耗，產(chǎn)生了顯著的碳協(xié)同減排效益。

此外，中國清潔空氣行動推動了清潔高效的能源設(shè)施取代低效、高碳能源設(shè)施的進(jìn)程，加速了能效提升、能源結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)型和產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)型。這一協(xié)同減排經(jīng)驗同時也為面臨空氣污染問題的發(fā)展中國家提供了向低碳發(fā)展路徑轉(zhuǎn)型的可能過渡方案。

未來，中國仍需要進(jìn)一步優(yōu)化能源體系和經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)以推動“碳達(dá)峰”“碳中和”目標(biāo)實現(xiàn)，而減排政策設(shè)計時應(yīng)當(dāng)重點關(guān)注具有顯著碳協(xié)同減排效益的相關(guān)措施。

來源：清華大學(xué)

論文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s41467-022-32656-8

13.研究顯示：全球 50 歲以下人群癌癥發(fā)病率急劇上升

美國科學(xué)家進(jìn)行的一項研究顯示，早發(fā)型癌癥（50 歲之前被診斷出的癌癥，包括乳腺癌、結(jié)腸癌、食道癌、腎癌、肝癌和胰腺癌等）的發(fā)病率，從 1990 年開始在全球范圍內(nèi)急劇上升。

研究人員發(fā)現(xiàn)，這種風(fēng)險在每一代人中都在增加。例如，1960年出生的人在50歲之前患癌癥的風(fēng)險比1950年出生的人更高。研究人員預(yù)測，這種風(fēng)險將在未來幾代人中繼續(xù)攀升。

在過去幾十年中，包括飲食、體重、生活方式、環(huán)境和微生物群在內(nèi)的早期生活暴露發(fā)生了重大變化。因此，研究團(tuán)隊假設(shè)西式飲食和生活方式等因素可能是導(dǎo)致早發(fā)型癌癥流行的原因。

自 20 世紀(jì) 50 年代以來，深加工食品、含糖飲料、久坐等風(fēng)險因素都顯著增加，研究人員推測這與微生物群的改變有關(guān)?！霸谖覀冄芯康?14 種癌癥類型中，8 種與消化系統(tǒng)有關(guān)?！毖芯咳藛T說，“飲食直接影響微生物組成，最終影響疾病風(fēng)險和結(jié)果?！?/p>

內(nèi)容來源：《中國科學(xué)報》

論文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s41571-022-00672-8